L'objectif global de l'IASC est d'améliorer la prestation de l'aide humanitaire, y compris la protection des droits des personnes touchées. Les principaux objectifs de l'IASC dans les situations d'urgence complexes et de risques majeurs sont de :

• développer et de mettre d'accord l’ensemble des partenaires sur les politiques à l’échelle du système global de l’aide humanitaire ;
• répartir les responsabilités entre les différents organismes dans les programmes humanitaires ;
• développer et de mettre d'accord, l’ensemble des partenaires, sur un cadre éthique commun pour toutes les activités humanitaires ;
• défendre les principes humanitaires communs, y compris à des organismes tiers ne faisant pas partie de l'IASC ;
• plaider pour le plein respect des droits de la personne, conformément à l'esprit des organes compétents et des principaux textes internationaux en vigueur (les droits de l'Homme, le droit international humanitaire, le droit des réfugiés) ;
• identifier et d’apporter des réponses dans des zones sinistrées où existent des lacunes dans les mandats ou dans la capacité opérationnelle ;
• et résoudre des différends ou des désaccords à propos ou au sein des agences humanitaires, sur les problématiques à l’échelle du système de l’action humanitaire.